Основными задачами ГУП «Мосводосток» являются:

1. Техническая эксплуатация гидротехнических сооружении централизованной системы водоотведения и водных объектов города в соответствии с регламентом технической эксплуатации сооружений централизованной системы водоотведения поверхностных сточных вод с территории города Москвы.
2. Сбор, транспортировка и очистка поверхностных и производственных нормативно очищенных сточных вод в московские водоотводящие сети.
3. Осуществление контроля за качественным и количественным составом воды, сбрасываемой предприятиями города в водоотводящую систему города и водные объекты.

На балансе ГУП «Мосводосток» находится: 46 прудов-отстойников и очистных сооружений, 18 сооружений камерного типа, 6 щитовых заграждений, 32 очистных сооружения МКАД и Третьего транспортного кольца, 116 водовыпусков, не оборудованных очистными сооружениями.

Специалистами Управления и территориальных отделов проведено обследование 75 объектов: главное офисное здание, 31 пруд-отстойник и очистные сооружения, 5 сооружений камерного типа, 1 щитовое заграждение, 7 очистных сооружений МКАД и ТТК, 30 водовыпусков, не оборудованных очистными сооружениями.

В ходе проверки были выявлены следующие нарушения:

• нарушения санитарно-эпидемиологических требований к охране водных объектов. Было отобрано 74 пробы сточных вод, из них не соответствовали требованиям санитарных правил: по химическим показателям 72 (97%) пробы, по микробиологическим – 68 (92%) проб.

Превышения гигиенических нормативов отмечены по следующим показателям: железо, нефтепродукты, химическое потребление кислорода, биологическое потребление кислорода, аммиак, общие колиформные бактерии, термотолерантые колиформные бактерии.

Самые лучшие показатели качества сбрасываемых сточных вод были отмечены на очистных сооружениях МКАД и Третьего транспорта кольца, которые были введены в эксплуатацию в 2000-х годах. Установлены незначительные превышения по железу, нефтепродуктам, микробиологическим показателям.

За неудовлетворительное качество сбрасываемых сточных вод на юридическое лицо по ст. 6.3 КоАП Российской Федерации наложено 38 административных наказаний в виде штрафа на сумму 668 тыс. руб.;

• нарушения санитарно-эпидемиологических требований при обращении с отходами производства и потребления: инструкции о порядке сбора, временного хранения и транспортирования отходов 1, 3, 4, 5 классов опасности отходов разработаны без учета классов опасности отходов для здоровья населения и среды обитания человека, инструкции о порядке сбора, временного хранения и транспортирования отходов 2 класса опасности не разработана, временное хранение отходов осуществляется с нарушениями требований санитарных правил, классы опасности отходов производства и потребления следующих наименований: строительные отходы, отходы железобетона, отходы полиэтилена в виде лома, для здоровья населения и среды обитания человека не определены и не согласованы с Управлением Роспотребнадзора по городу Москве. На юридическое лицо по ст. 8.2 КоАП Российской Федерации наложено 2 административных наказания в виде штрафа в размере 500 тыс. руб.;
• нарушение санитарно-эпидемиологических требований к эксплуатации общественных помещений, зданий. На 42 рабочих местах в главном офисном здании были проведены замеры уровней освещенности, микроклимата, уровней напряженности электрических полей. Не соответствовали требованиям санитарных правил: 42 рабочих места – по параметрам микроклимата, 25 рабочих мест – по уровням освещенности, 2 рабочих места – по уровням напряженности электрических полей. На юридическое лицо по ст. 6.4 КоАП Российской Федерации наложено 3 административных наказания в виде штрафа в размере 51 тыс. руб.;
• нарушения санитарно-эпидемиологических требований к атмосферному воздуху: в местах проживания населения в зоне влияния выбросов  объектов ГУП «Мосводосток» (прудов-отстойников и снегосплавных пунктов) не проводились лабораторные  исследования загрязнений атмосферного воздуха. На юридическое лицо по ст. 6.3 КоАП Российской Федерации наложено 1 административное наказание в виде штрафа в размере 12 тыс. руб.;
• нарушения порядка организации и проведения производственного контроля за соблюдением санитарных правил: для объекта по адресу: г. Москва, наб. Тараса Шевченко, д. 31, программа(план) производственного контроля не была составлена и не утверждена руководителем организации. На юридическое лицо по ст. 6.3 КоАП Российской Федерации наложено 1 административное наказание в виде штрафа в размере 12 тыс. руб.

По результатам проверки вынесено 45 постановлений о назначении административного наказания в виде штрафа на общую сумму 1 млн. 243 тыс. руб.

Выданы представления об устранении причин и условий, способствовавших совершению административных правонарушений, предписания об устранении нарушений санитарных правил.

ГУП «Мосводосток» представлен план мероприятий по устранению нарушений санитарных правил на 2013-2015г.г., который включает в себя: ужесточение контроля за проведением регламентных работ, проведение испытаний по применению препаратов для обеззараживания сточных вод, подбор сорбирующих боновых заграждений, изучение возможности применения биотехнологий при очистке сточных вод.